Eiropas Savienības līmenī komercdarbībai sniegtā un plānotā atbalsta kontroli (uzraudzību) saskaņā ar Līguma par Eiropas Savienības darbību 108.panta nosacījumiem, kā arī citiem Eiropas Savienības tiesību aktiem, veic Eiropas Komisija.
Eiropas Komisijas Konkurences ģenerāldirektorāts ir tā institūcija, kas ir atbildīga par konkurences politikas piemērošanu un attīstību Eiropas Savienības interesēs. Eiropas Komisijas ekskluzīvajā kompetencē ietilpst izvērtējums par valsts atbalsta pasākuma saderīgumu ar Eiropas Savienības iekšējo tirgu.
Savukārt nacionālā līmenī Finanšu ministrijai kā nacionālajai komercdarbības atbalsta kontroles (uzraudzības) institūcijai atbilstoši Komercdarbības atbalsta kontroles likumā noteiktajam ir šādas funkcijas (likuma 9.pants):
- veikt ikvienu plānoto atbalsta programmu vai ad-hoc atbalsta projektu, kā arī ikvienu plānoto grozījumu esošajās atbalsta programmās vai ad-hoc atbalsta projektos sākotnējo izvērtēšanu;
- nosūtīt Eiropas Komisijai pieteikumus par plānotajām atbalsta programmām vai ad-hoc atbalsta projektiem, kā arī par plānotajiem grozījumiem esošajās atbalsta programmās vai ad-hoc atbalsta projektos.
- gatavot ikgadējo pārskatu par komercdarbībai sniegto atbalstu;
- sniedz konsultatīvu palīdzību komercdarbības atbalsta kontroles jomā;
- nodrošina de minimis atbalsta uzskaites sistēmas administrēšanu;
- organizē informācijas apriti ar Eiropas Komisiju komercdarbības atbalsta jautājumos.